鹽水武廟相傳創建於清康熙七年（西元1668年），清嘉慶四年（西元1799年）鹿港林文濬出資擴大改建，奠定規模。現今所見之樣貌為1972年所重建，後殿則建於1983年，為3樓建築， 1樓為「玉蓮寺」，2樓為「五恩主殿」，3樓為「凌霄寶殿」，1997年廟旁另興建文物館。
正殿前龍邊長達三公尺的巨大木製樑籤、古神佛、古香爐、古木聯、聖旨匾都是紀錄武廟歷史的重要文物，廟前廣場高30尺的關聖帝君像則是最大特色，使得鹽水武廟成為台南鹽水著名的名勝古蹟。
鹽水蜂炮習俗則是與武廟有相當深厚的淵源，相傳在清光緒年間，鹽水地區發生瘟疫，居民祈求關聖帝君解厄消災，關聖帝君指示將於元宵夜出巡，並且命令周倉將軍為前導，帝君神轎殿後護隊，眾信隨神轎一路燃放鞭炮，遶境大街小巷驅逐邪魔，自此瘟疫絕跡。
從此每年元宵節便以蜂炮驅逐瘟疫，演變至今成為放蜂炮活動，是每年鹽水地區最重大的地方盛事，武廟也就此成為鹽水蜂炮的主辦單位。而據說在元宵節當天被蜂炮炸得越多，來年運勢就會越旺，也因此吸引國內外遊客走入鹽水，體驗獨特的犁蜂炮民俗活動，帶動宗教文化旅遊熱潮。（攝影／范銘偉）