中國社會科學院台灣研究所副研究員徐青指出，馬英九勝選後，兩岸和平穩定勢頭肯定能持續下去，包括台灣參與國際活動、兩岸互設辦事處、兩岸經濟合作架構協議（ECFA）等，都應該會是優先推動的目標。
不過，有關馬總統在大選期間提出的兩岸簽署和平協議，徐青認為，應該不會在馬英九的第二任期簽署，但國民黨有可能把兩岸和平協議當作2016年總統大選時的訴求，並在馬英九第二任期中，加深兩岸學者、智庫對兩岸和平協議的探討，以凝聚台灣內部共識。
他指出，兩岸和平協議的簽署，要看定位，到底是終極、比較高層次的終結敵對狀態，還是以「九二共識」作為基礎的低階和平協議兩岸模式概念；如果採低階模式，就要看大陸認不認可。
徐青表示，兩岸簽署和平協議，需要馬英九得到台灣足夠民意支持，也必須和大陸先溝通好，還要「美國放手」，才有可能簽署。
因此，他認為，兩岸下一步應該會優先推動互設綜合性辦事機構，因為台港已先行先試，互設綜合性辦事處，接下來可能就會擴及兩岸，大陸目前較傾向用大陸海峽兩岸關係協會、台灣海峽交流基金會的兩會架構。
對台灣參與國際活動，徐青認為是兩岸交流最敏感、最容易爆發衝突的議題，兩岸可能會以先擱置爭議，採共識來處理，累積善意和互信，這樣台灣參與國際活動也就不會有太大問題，這可能也會是兩岸和平協議的突破口或起點，就像ECFA一樣。
至於馬英九是否能在第二任期赴大陸訪問，徐青認為，馬英九赴大陸的問題不在大陸這邊，而在他自己那邊。
對馬總統勝選，全國台灣研究會執行副會長周志懷則認為，兩岸關係又將獲得可穩定、可持續、可預測的4年，台灣經濟也將獲得繼續提升的內外環境。