對於兩岸貨幣清算機制，是否涉及複查的主權議題，陳冲強調，如果把貨幣看成是日常生活交易的工具，它就沒有那麼複雜的主權議題，但清算機制細節需要問央行
陳冲強調，去年下半年以來，包括ＯＢＵ（國際金融業務分行）與海外分行辦理人民幣業務，或是陸銀來台參股等涉及兩岸的財經政策，都陸續宣布開放，顯示兩岸交流持續進行當中。
除了循序漸進，陳冲強調，兩岸交流基礎，必須建立在雙方互信上面，所謂的互信基礎，除了兩岸當局、兩岸業者之間的互信，本國主管機關與業者（包括本國與對岸業者）也需要建立互信，就像男女交往一樣，雙方也要認識一段時間，有了互信，才論及婚嫁，他強調，兩岸金融業務與投資管理辦法，對於陸銀參股的本國金融機構，並未僅侷限於金控業，其他金融機構也得引進陸資。
陳冲認為，兩岸金融機構這幾年儘管在檯面下頻頻交流，但他認為，兩岸業者的互信基礎，還沒有穩定到一對一坐下來談婚嫁的地步。
央行官員透露，我方前年十月就已將清算機制建議交給大陸人行，希望儘快可就此議題再度溝通雙方意見，但目前時間仍未敲定。
據透露，央行曾建議雙方各指定一家銀行，互設人民幣與新台幣帳戶以進行匯款清算，但相關提案被人行否決，認為這只是權宜之計，不如等雙方達成共識後，再一次到位比較好。
未來一旦兩岸簽署貨幣清算協定，本國銀行將可開辦人民幣業務，一般預估，九成人民幣業務將可從目前的國際金融業務分行(ＯＢＵ)轉至國內分行(ＤＢＵ)承辦，台商也可直接開立人民幣支票，這些都有利兩岸貿易貨幣交流。