由於熱氣球是依靠氣流飛行，控制者要能判斷風向、掌握氣流飛行，駕駛的飛行經驗相當重要。
台灣還沒有發展熱氣球的成熟環境，近來有單位開始申請熱氣球飛行計畫，必須向民航局飛航管制組申請，一旦獲得通過，民航局會公布「飛航公告」飛航空域，提醒其他航空器避開該空域。
至於台灣常見在城市大樓上掛著廣告熱氣球，李萬里說，這屬於繫留熱氣球，不在航空器範圍，但因為綁在城市區域，也可能影響其他航空器的飛行，因此仍必須向民航局申請才能繫留。需要升空的熱氣球，一定要先向民航局提出計畫，民航局要確保其他飛機等飛行器不會與熱氣球在「空中擦身」。
中華民國熱氣球飛行運動協會理事長夏學常表示，熱氣球本身並無動力系統，風速、風向是影響熱氣球空中運動的主要因素，降落時也得要依賴順風才能穩定降落；一天中日升、日落前一到二小時的氣流是最穩定的時段，也最適合熱氣球飛行。