為展現大台南市升格後的新氣象，市府舉辦市鳥、市樹、市花選拔活動，農業局蒐集各方意見後，市鳥共有：水雉、草鴞、五色鳥、高蹺?、黑面琵鷺；市樹則有流蘇、苦楝、茄苳、樟樹、鳳凰木；市花有桂花、蓮花、樹蘭、山芙蓉、鳳凰花、蝴蝶蘭、台灣百合，由市民票選。
由於在市花部分，農業局一開始時並沒有將原台南市市花「鳳凰花」列入，引起爭議，最後雖然「補提名」，但也意外引發「市花保衛戰」。
黑琵與鳳凰木 遙遙領先
票選才剛剛開始，截至昨日下午，市鳥及市樹方面，黑面琵鷺與鳳凰木分別以八百多票及九百多票遙遙領先其他物種，但市花方面，排名第一的鳳凰花取得五百多票，只以幾十票的差距，暫時領先排名第二的蝴蝶蘭。
鳳凰花蝴蝶蘭 各有所愛
台南不少藝文團體，紛紛透過各種方式，強烈表達應該把鳳凰花繼續訂為市花，「留下台南的顏色」，文資協會理事長詹伯望更發表公開信，強調花比樹更重要，希望大家一起來留下代表台南人熱情的鳳凰花。
彰顯合併特性 推薦蓮花
但也有原台南縣民持不同看法，認為為彰顯合併特性，應該取兩地特色共治，除了近來為台南打響知名度的蝴蝶蘭以外，還推薦具有清香和提升地方產值的白河蓮花，各有支持者。