12年國教實施後，國中生將依畢業國中所在免試就學區參加免試入學。中國國民黨籍立委洪秀柱在教育及文化委員會質詢指出，宜蘭慧燈中學7成5都是雙北市與基隆學生，為何不能納入北北基免試入學？
吳清基表示，教育部就此有開過會，學生如果因為家庭或父母工作等特殊因素，無法以國中所在地參加免試，要跨區的話，教育部會擬相關因應措施予以考量，教育部會出面和台北市協調，儘量幫助學生。
教育部中等教育司司長張明文在委員會休息時接受記者採訪補充表示，有的學生因為家庭或父母工作因素必須遷戶籍，或戶籍不在國中畢業所在地，教育部就此已開過會，會優先以學生權益做最大考量，相關細節交給各區討論後，明年4月一起納入規範，全國做統一規定。1001117