蔡英文520上台至今，再過兩個多禮拜即屆滿百日，卻傳出駐世界貿易組織（WTO）常任代表遲遲未完成交接。據平面媒體報導，蔡英文早在7月中就特任中研院院士朱敬一為駐WTO新任代表，馬英九時期的原任代表賴幸媛卻未回報離任程期，變相耽擱了朱敬一的規劃。 《自由時報》報導指出，駐美代表、駐日代表已於6月到任，駐WTO常任代表卻遭卡關。報導引述外交人士說法，由前總統馬英九任命的代表賴幸媛，有意待到10月才走，讓外交人士及綠營頗為不滿。依規定，朱敬一須於3個月內抵任，也就是10月初，賴幸媛交棒時間幾乎壓在底線。 外交部表示，特任代表不一定要隨前任政府辭職或離任，端看離任時駐地是否有其他任務而定。部分民進黨立委卻認為，特任駐外人員應跟隨原政府同進退，呼籲賴幸媛盡速打包走人。 前總統馬英九甫上台，即任賴幸媛為陸委會主委，直到第二任期時，將她轉任為我國駐世界貿易組織代表團代表。今年7月15日賴幸媛已准辭職，應予免職。賴幸媛則發表聲明回應，7月27日已跟外交部確定，安排9月30日移交。