推動美日雙邊貿易協定是歐巴馬此行訪日的主要重點之一，而日本也希望藉此強化美日同盟關係以加強對中國牽制力，歐巴馬亞洲行原本因為臨時增加訪韓行程而縮短訪日，經過日方不斷的折衝，最後恢復為三天兩夜。這是日本十八年來首次以「國是訪問」規格接待美國總統，可見日方重視程度。
共同社報導，在跨太平洋夥伴協議（ＴＰＰ）談判陷入僵局後，美日曾一度考慮不發表雙方元首聯合聲明或共同宣言，直到歐巴馬敲定訪日行程後，雙方才又就發表共同文件一事重新展開協調。日美關係消息人士透露，日方提議在共同文件中寫明美國對釣魚台的防衛義務，而美方僅同意寫明在日本施政權之下的區域屬日美安保條約適用對象，不希望寫入島嶼具體名稱。
美：本就適用 毋須刺激中國
報導指出，美方認為沒有必要在元首層級文件刻意寫入釣魚台，而且即使沒寫入也能充分表達釣魚台屬安保條約適用對象，不願因此過度刺激中國。每日新聞報導，安倍日前在東京都的一場演講中，就即將舉行的日美元首會談表示，各國有必要促使中國做為一個負責任的國家和平崛起，顯示其有意透過元首會談加強對中國牽制。