一群反課綱學生和民眾在7月23日晚上闖入教育部，並進入部長辦公室，結果共有33人被逮捕，包括24名學生、6位民眾與3名記者，教育部長吳思華當時召開記者會，表示將對這些學生和記者提告，但吳思華1日接受中央廣播電臺「早安臺灣」節目專訪時指出，教育部目前並未對學生提告。吳思華：『(原音)我們在事情發生的第二天，我們正式的說我們要提告，其實我們到現在還沒有正式提告，我們當天的說明，其實是希望讓社會大眾可以有一個共識，那就是台灣社會是一個法治社會，我們每一個人都應該遵守法律，更最重要的是，我們不希望有其他的團體讓同學們在他們不瞭解情況下，做出脫序的行為，這是我們最大的期待。』
吳思華強調，對於夜闖教育部的高中生，教育部基本上不想去追究相關的法律責任；至於其他非就讀高中的學生，如果願意承認夜闖公署是件脫序行為，教育部也願意採用法律以外的方式來處理。
針對反課綱學生目前仍在教育部前集結、靜坐，吳思華表示，他一直很希望可以和這些學生溝通，31日下午，他原本期待學生代表能和他一同在教育部前庭坐下來談，但沒想到學生的表達方式實在過於激烈，讓教育部沒有說明的機會，他希望在最短的時間內，能夠找到適合彼此的溝通方式。
吳思華也說，預計在8月5日舉辦的「部長時間」，原則上會如期舉辦，屆時國教署將進行網路直播，網友也能線上提問。他並呼籲各地方政府，既然新舊教科書已併行上路，各縣市政府就應該將選書權回歸各校，如此才能維持行政穩定。