自從敘利亞內戰在2011年3月爆發以來，已經有好幾千名大陸聖戰士前往敘利亞，跟敘利亞政府軍及其盟軍作戰。其中有些人加入蓋達組織(al-Qaida)在敘利亞的分支，也就是努斯拉陣線(Nusra Front)，其他人則向伊斯蘭國組織(Islamic State)宣誓效忠。另有少數人加入勢力龐大的反抗軍團體「黎凡特自由人伊斯蘭運動(Ahrar al-Sham)」等極保守派系。
努斯拉陣線現已改名為「敘利亞征戰陣線(Fateh al-Sham Front)」。
不過，多數大陸聖戰士都加入敘利亞土耳其斯坦伊斯蘭黨，這些成員大多數是大陸的穆斯林，尤其是來自新疆、說土耳其語的維吾爾人。他們在敘利亞扮演的角色越來越顯著，導致敘利亞和中國的情報單位合作，他們擔心，這些聖戰士有朝一日可能返回家鄉，在當地製造麻煩。
土耳其斯坦伊斯蘭黨的另一個名稱是「東土耳其斯坦伊斯蘭運動(East Turkistan Islamic Movement)」，簡稱東伊運，他們認為新疆就是他們的東土耳其斯坦。
就像敘利亞大多數的聖戰團體，土耳其斯坦伊斯蘭黨的目標是要推翻巴夏爾的世俗政府，並改採嚴格的伊斯蘭律法統治。他們之所以加入敘利亞內戰，是因為中國政府是巴夏爾政權在國際上最堅強的支持者之一。中國與俄羅斯利用他們在聯合國安理會的否決權，多次擋下了國際對敘利亞的制裁。
敘利亞內戰已經造成將近40萬人死亡，好幾百萬人流離失所。
北京一再將發生在新疆以及世界各地的中國目標，所遭到的暴力攻擊，都怪罪到伊斯蘭好戰份子頭上。因為這些份子與外國有聯繫，意圖在新疆建立一個獨立的國家。
大陸政府認為，有些好戰份子逃離大陸，加入聖戰。但有批評者指出，維吾爾人遭到歧視，自己的家鄉在經濟上被邊緣化，而且他們只是希望逃離漢人政權的鎮壓統治，這才是主要的原因。