根據年金改革方案草案，若退休公教人員支領月退休金者，若總額超出「基本生活保障」，就是新台幣25,000元或32,160元，其18%優惠利率將分6年、3階段全數歸零。歸零或調降後的優惠存款本金則交還本人。
在優惠存款利率歸零後，未來退休公務人員年金的平均所得替代率先調降至本俸2倍的75%，再逐步調降至本俸2倍的60%，約等於非主管人員實質薪資的70.8%。委員會召集人副總統：『(原音)我們先調整他降到本俸2倍的75%，那個時候再每一年降1%，逐步調整至預定目標60%為止。我們希望藉著這樣的調整，使不同的職業別之間年金所得替代率的差距才能夠拉近，然後減輕各職業別社會保險跟退休制度的財務負擔，當然也跟國際各個國家能夠接軌。』。
以一名任職35年，於民國100年退休的公務人員薦任七等年功六級590俸點的非主管來說，目前所領月退休金及優惠存款所得共新台幣63,608，明年將降到58,635元，減少近5,000元；16年後則降到46,908元，比目前減少16,700元。
另外，請領年齡將逐年延後至65歲，提前或延後退休者，得領取「減額年金」或「增額年金」，依每年4%降低或增加年金給付額度，年限最多5年，但針對警察、消防等危險勞動，或是中小學教師等特殊職務者，將另訂定更早的請領年齡，允許其額外再提前請領減額年金。
至於費率，將逐年提高1%，並於費率達到15%時，檢討整併公教人員保險的可行性，訂定最適費率；若無更佳方案，則費率逐年調高至18%為止。在費率調高的同時，政府財源未來也將挹注基金。改革方案也設計「年金年資可攜帶制度」，以「合併計算年資、分別計算年金」，讓跨職域就業有保障。
至於軍人年金制度，則因軍人的服役特性，將另外單獨設計。