北市警方日前逮捕闖入教育部的學生和民眾，其中包括3名記者，引起侵犯新聞自由的爭論。
台北市長柯文哲28日表示，目前的資訊都很片面，因此，他已指定副市長鄧家基組成專案小組，希望釐清事實真相。他說：『(原音)我們昨天就已經指定鄧家基副市長去組織一個專案小組，我們一定把記者找來、把學生找來、還有警方三方資料收集。當然最後警方還是會送報告上來，反正就按照最後調查報告再決定怎麼處理。』
對於媒體批評柯文哲過於袒護警方，柯文哲則認為課綱是政治案件，「上游不解決」，拖到最後警察不得不處理，這種事情不該讓事務官或公務員扛責任。對於網路有照片流出，顯示當天學生架住教官，柯文哲則指出，這樣「看圖說故事」，很難回答問題，還是讓專案小組調查後再處理比較好。