中國大陸在未與台灣完成協商的情況下，即逕行發布距離海峽中線不到8公里的國際新航線M503，以及穿越金門、馬祖空域，事先從未知會台灣的3條橫向新航路W121、122、123，引發我方強烈不滿，不僅交通部要求大陸與我方協商，將M503往西移；立法院朝野也罕見做出一致決議，呼籲大陸知所節制，避免片面改變台海現況。
目前距離大陸方面宣稱實施新航線的日期僅剩1個月，交通部長陳建宇3日在交通部新春記者會前受訪時證實兩岸已在協商，不過由於事涉敏感，暫時無法對外透露更多細節。陳建宇說：『(原音)已經開始在作業了，因為談判有涉及到比較敏感性的問題，容許我現階段沒有辦法跟各位做回覆，但事實上雙方面已經在談了。』
陳建宇指出，交通部已讓陸方充分了解立法院藍、綠兩黨共同的要求，並希望陸方不要傷害台灣民眾的感情，現階段雙方還在持續溝通，等有進展就會對外公布。