全民健保的給付並非包山包海，依健保法規定，當民眾發生車禍、公共安全事故、食品中毒等案件時，健保代墊醫療費用後，可以再向保險公司請求補償。
健保署指出，健保的代位求償案件中最多的就是汽、機車交通事故。統計去年共向強制汽車責任保險下的「汽車交通事故特別補償基金」求償12萬1,425件，求償總金額達到25億元。健保署財務組組長洪清榮說：『(原音)健保署對汽車交通事故造成的一些生病的給付，在103年，也就是去年，全年大概件數有12萬1,400多件，整個求償金額是有25.2億，這個件數歷年來最高，但是金額有稍微縮減。』
跟前一年相比，去年的交通事故求償案件多了2千件，但是求償金額卻減少了5億元，洪清榮說，主因是去年改變求償原則，剔除一些像是感冒、皮膚病等與車禍無關的醫療項目。
除了交通事故外，去年發生的澎湖復興空難、2起食安中毒事件，健保也依法代位求償；而高雄氣爆事件、新店氣爆事件與台北捷運殺人事件則是還沒獲得補償，正在司法訴訟當中。