銀杏門植物(Ginkgophyta)早在2億7千萬年前就已經出現在地球上，是相當古老的植物，但經歷地球環境驟變，現今銀杏只剩下1個種類，目前植物學界對於銀杏在植物演化史中的親緣演化地位眾說紛紜。
中研院生物多樣性研究中心特聘研究員趙淑妙的研究團隊在1997年就曾提出銀杏與蘇鐵有姊妹群關係，也就是來自同一源種，但這種假說當時不被認同，直到利用一套包含25種裸子植物的葉綠體基因體資料庫演算和比對後，發現以氨基酸序列所建構的親緣演化樹有可信度，等於支持了銀杏和蘇鐵植物是姊妹群的假說。趙淑妙說：『(原音)我們這一次就是用25種葉綠體基因體序列來重新分析，把過去人家分析的東西用最新模型分析，發現用胺基酸的序列比較可靠，我們就發現應該是跟蘇鐵在一起，支持我們過去的看法。』
雖然當時研究團隊提出的假說沒有馬上獲得認同，但教科書已在2009年修改了內容，這次的研究成果也再次證明了假說，並登上國際期刊「基因組生物學及演化」(Genome Biology and Evolution)。