根據警方調查，黃中研當時正在新光醫院門診大樓地下一樓的診間看診，案發時先聽見門打開的聲音，接著就看見一名身著淺灰色外套、中等身材、年約30餘歲男子，右手持著一根短鐵棒，看見他就直接朝他頭部攻擊，黃中研下意識抬起左手護住頭部，再伸出右手抵擋並轉身閃躲，右大腿則遭到男子毆打，一名男性患者出手相救，試圖拉開男子未果，男子攻擊完後離開診間，在門診大樓攔了計程車離去。
警方調閱醫院監視器，循線找到這名林姓計程車司機。林姓司機表示，男子指示前往台北火車站，曾透露要搭車南下，目前警方正在追查這名男子的蹤跡與行凶動機。