總統馬英九昨日批准中研院長翁啟惠的辭呈，外界質疑翁啟惠辭呈於3月底就已送交總統府，為何馬總統在任期只剩9天時批准辭呈，並且要面試3位中研院長候選人。對此，民進黨立委陳亭妃今(11)日表示，在這個時間點批准翁啟惠辭職，讓人質疑馬總統是要在總統交接前決定院長人選，有要「卡」準總統蔡英文人事佈局的意味。
陳亭妃表示，現在距離520新政府上台的時間不到10天，馬總統現在突然之間處理中研院長的辭呈，然後還要以最快的速度與3位院長候選人面談，這不得不讓人質疑馬總統是要在520之前決定中研院長人選，才批准翁啟惠辭職。
陳亭妃批評，「政治謀略實在太過嚴重」，新舊任總統馬上就要交接，應該把人事權交給蔡英文來處理，畢竟未來中研院長是要與蔡英文配合，如果由馬總統來做決定，她認為這一部分是有疑議和不妥，「非常讓人質疑是要卡蔡英文總統的人事佈局」。