台南市長賴清德堅持議長李全教司法未釐清前不進議會，因此遭議會送請監察院彈劾，但是賴清德認為，府會政治問題不在監察院監理範圍，而監察院4日以7:2的票數通過彈劾案，將賴清德移送公務員懲戒委員會。
彈劾案由指出，賴清德經合法邀請拒不列席議會，並導致所屬曲為附和相繼違法，「首開地方自治史上官員集體不進議會之惡例」。
監委認為，賴清德拒進議會迄今長達半年之久，違反地方制度法規定，背離宣誓條例規定，嚴重傷害現代民主法治國基本原則，逾越憲法與地方制度法規範地方自治團體首長行政權基本界線，架空地方立法權，動搖民主社會基本核心價值，悖離公務員對鮮法忠誠義務，違失事證明確，情節重大，因此依法提案彈劾。
該案是由監委仉桂美、包宗和主查，參與審查會的監委包括尹祚芊、江明蒼、林雅鋒、李月德、高鳳仙、陳小紅、陳慶財、蔡培村、劉德勳。審查會成立票7票，不成立2票，通過彈劾。