遲遲未能整合成功的2016立委選舉第三勢力，可能破局。由於綠黨桃竹苗市黨部與北北基市黨部基層反對，綠黨與社民黨等第三勢力原訂今（3）日簽訂合作備忘錄暫告破局。據了解，由於綠黨與社民黨在政黨補助款分配比例，以及不分區排序原達成共識，但因綠黨內部份黨員等人認為合作比例不公平，綠黨新竹市議員周江杰、桃園市議員王浩宇也因認為綠黨基層實力與社民黨有所差距，第三勢力首個合作案仍未能成形。不過，綠黨秘書長許博任則表示，目前黨內還有部分意見，主要仍以程序問題為主尚待溝通。
綠黨與社民黨、時代力量黨近日持續針對第三勢力政黨合作案進行協商，許博任指出，上周五綠黨與社民黨間的合作備忘本已進入最後定稿，待今日與社民黨完成備忘錄簽訂一事。
然而，就在上周四綠黨召開臨時中執會，卻因綠黨基層，包括同志黨部、原住民黨部對於黨中央決策大為不滿，綠黨原住民黨部黨員在中執會現場揚言退黨。綠黨與社民黨合作條件之一，綠黨提出，2016立委選舉政黨補助款分配比例5：3：2，由黨齡20年的綠黨取得5成比例，3成由社民黨分配，2成作為政黨發展雞金，只是此項條件遭社民黨反對。
再者，綠黨也希望，兩黨共組聯盟下，不分區前三席由綠黨所提出立委參選人排序，兩黨在此條件下也有意見落差。不過，對於條件談不攏的說法，許博任說，兩黨在後續的協商已經達成共識，雖然與上述分配條件略有不同，但仍相差不遠，且兩黨雙方已有初步共識。
只是，在上周四的綠黨臨時中執會上，已是現任市議員的周江杰與王浩宇等人，對於綠黨與社民黨要達成合作仍有不同意見。他們認為，兩黨基層經營差距甚遠，綠黨已經在桃竹苗等地扎根基層，而綠黨黨中央與社民黨間的合作並未考慮到兩黨的實力並不對等。在這樣的前提下，上周四綠黨9位中執委中有5位中執委對第三勢力合作備忘錄仍抱持反對的態度。不過，許博任對此則澄清，並未有5位中執委反對的事實。
對於合作備忘錄破局，以及綠黨內部對第三勢力合作意見分歧，許博任澄清，合作備忘錄是上周五原已定稿，還沒簽定合作，但因綠黨內部持續對於綠黨與其他第三勢力合作仍有雜音尚待溝通，因此今天仍未簽訂合作備忘錄。
許博任強調，綠黨內部僅是針對合作的程序問題有所質疑，因為部分合作內容不適合在簽訂前馬上公開，因此綠黨部分成員對綠黨內部的資訊透明有意見，而非外界所傳的，兩黨對於合作的條件，有所疑慮進而造成合作破局。
社民黨秘書長葉虹靈則表示，社民黨仍抱持開放的態度與綠黨等第三勢力政黨進行合作。