反課綱群眾31日凌晨侵入教育部後，仍有百人守在廣場，堅持「課綱不退、我們不退」，台北市長柯文哲下午兩點半，前往教育部，探視學生與警察同仁，柯文哲表示，同學們關心社會議題，他表示嘉獎，但是要注意安全，也不希望有太激烈的行動，更重要的，警察也是人民的保姆，不是人民的公敵，所以在抗議當中，不要給警方造成太大的困擾跟壓力。
柯文哲說，希望各位同學在表達抗議的時候，還是要用理性平和態度，不希望大家用太過激的方法來表達抗議，畢竟台灣還是要邁向一個文明的社會，抗議是維護自己的權益，但是不要太過激，他也要拜託警察同仁，他知道在這種大熱天，要心平氣和也是非常困難，但雙方還是要儘量克制。
柯文哲指出，今天還是希望說，關於課綱的問題，還是請教育部長吳思華，能儘速跟學生面對面、達成協議，把這件事情結束掉，台灣還是不希望因為意識型態，限入兩極的抗爭，所以不管是學生或警察，請大家保持平和理性，不要有太過激的行為，請雙方克制。
柯文哲重申，希望教育部在這個問題上面，儘速跟學生達成協議，讓事情落幕。
柯文哲最後說，其實今天他有帶一些餅乾，來給學生和警察同仁，「吃甜的東西心情會好一點」，不過這麼熱會吃不下去，所以請各位同學還是到樹蔭下，不要中暑。
在場的反課綱學生一再要求柯文哲，保證絕對不會逮捕學生，不過柯文哲僅表示，只要學生不會有過激行為，警方絕對會克制、柔性處理。