空軍在6月8日向媒體公開IDF與F-16抗戰紀念彩繪機，由於戰機機艙單側塗上日本「日之丸」國旗，象徵二戰時擊落日機戰果，引發日方向外交部表達關切。國防部1日上午臨時記者會中，日本媒體甚至要求空軍對此道歉，國防部表示，抗戰勝利70週年相關活動規劃皆力求符合史實，空軍不需要為此事道歉，亦無道歉的問題。網友也力挺國防部表示，日本才應該就發動二戰的罪行先道歉。
國防部30日表示為避免引發誤會，已經將號彩繪機上日本國旗工標塗銷，反而引來「矮化國格」批判。空軍發言人張哲平中將表示，塗上「日之丸」功標事前考慮不周詳，但是絕無受到施壓一事。
朝野立委對此事件則是看法不一，根據《自由時報》報導，民進黨立委黃偉哲表示，台日不處於戰爭狀態，台灣也沒有擊落過日本戰機，卻在現役戰機上噴塗日本國旗，不知所為何來？立委蔡煌瑯則表示，「日本是重要友邦，國防部從善如流，接納日本意見是應該的。」
不過，國民黨立委林郁方表示，因為日本抗議就改掉，很怪異也有失台灣國格。
對於日本媒體要求國防部道歉，國防部發言人羅紹和少將1日下午語氣堅定表示，抗戰勝利70週年相關活動規劃皆力求符合史實，空軍不需要為此事道歉，亦無道歉的問題。
多數網路輿論則支持國防部，認為日本人才應該先就二戰的侵略行為道歉。前陸軍司令吳斯懷反問日本媒體稱，「八年侵華戰爭，我們三百多萬軍人，兩千多萬人民犧牲生命，台灣慰安婦的悲慘一生，你們公開道歉過嗎？」