由於我方無法接受菲律賓總統府所發出的道歉聲明，行政院長江宜樺15日晚間6時召開國際記者會宣布，立即啟動對菲律賓的第2波8項反制措施，並且不排除有第3波制裁。同時，國安會成立「對菲制裁措施應變監督小組」，以密切監控制裁實施情形。
針對「廣大興28號」漁船船員遭菲律賓公務船槍殺事件，府院高層今早召開國安會議，馬總統無法接受菲律賓如此輕率敷衍的結果，裁示即刻採取凍結菲勞申請、召回我國駐菲律賓大使，以及要求菲律賓駐華代表返國協助妥善處理本案等3項制裁措施。
關於本案之後續發展，江宜樺上午召開記者會表示，若馬尼拉經濟文化辦事處（MECO）理事主席裴瑞茲（Amadeo R. Perez）能於今日來台時，帶來符合我方要求之正式聲明，我方才會考慮取消前述3項制裁措施；相反地，若裴瑞茲表達之正式回應仍然無法符合我方期待，我政府將啟動第2波反制措施，共包含下列8項：
一、發布菲律賓旅遊警示燈號為「紅色」，針對我國籍「廣大興28號」漁船事件，菲律賓政府對我國不友好之作法，造成台菲目前關係緊張，因此不鼓勵赴菲律賓旅遊或洽公。二、停止台菲雙邊高層交流與互動。
三、停止菲方經濟交流、推廣及招商等相關活動。四、停止台菲農漁業合作事項。五、停止雙方科技研究交流與合作計畫。
六、停止台菲航權談判。七、停止菲律賓人士用「東南亞5國人民來台先行上網查核」免簽證措施。八、國防部及海巡署在南方海域辦理聯合海上操演。
★菲律賓總統府聲明避重就輕
菲國總統府馬拉坎南宮下午發表聲明，「總統艾奎諾三世已指示裴瑞茲為他的個人代表，就不幸與無意造成的生命損失，傳達他和菲律賓人民對洪石成家屬與台灣人民的遺憾與道歉。」
聲明指出，「菲國調查局（NBI）奉總統令，已展開調查並承諾將就此事件進行徹底、完整、公正且迅速之調查。調查局已將此案列為最優先處理案件。」
聲明還說，「我們瞭解罹難者家屬與台灣民眾對此不幸損失。」
我國府院高層下午召開國安會議後，由行政院長江宜樺召開國際記者會，外交部、國防部、經濟部、交通部、法務部、農委會、海巡署、勞委會、國科會等部會首長出席。
江宜樺宣布，裴瑞茲已抵台灣，但目前沒有被菲國總統充分授權，顯示菲政府沒有解決這事件的誠意，所以我國立即啓動8項反制措施。
★ 國安會成立「對菲律賓制裁措施應變監督小組」
江宜樺表示，雖菲國已發出聲明表示遺憾與歉意，「可說是代表菲律賓官方對我方的正式道歉」，予以肯定，但聲明中提到，洪石成先生的死亡事件不幸且非意料中的生命喪失，對於這樣的敘述，「我們完全無法接受」。
江宜樺說，資料顯示，該漁船身上，彈痕累累、遍佈全船，以平面圖來講，散佈在每個角落，對駕駛艙、船艙加以掃射，「我們實在無法接受這是一個疏忽或非意圖的射殺行為」。
他說，菲國聲明一方面表達歉意，但另一方面又強調這不是一個故意的殺人事件，整個處理顯得「拖泥帶水、避重就輕」，對我方提出其他3項正式要求，沒有給予完全的回應，菲國說辭「反反覆覆、誠意不足」。
江宜樺表示，菲國執法人員在我國專屬經濟海域殺害我國漁民，這樣的做法已違反國際法、海洋法和人道原則，事發後至目前為止，對這件事件完全缺乏解決誠意，當我國祭出若干制裁措施時，又以這樣電報聲明來虛應故事、含糊其辭，在與我方談判時只是不斷拖延時間，我們對此感到十分無法認同，政府將持續對菲強烈譴責跟抗議。
他還說，我國上午宣布已實施的3項制裁，已中斷菲勞來台申請，駐菲大使也將在今晚返回台灣，菲駐華代表預定在明天搭機返國；8項新措施從現在開始生效。
江宜樺表示。國安會為了密切監控兩階段制裁措施實施情形，已成立「對菲律賓制裁措施應變監督小組」，行政院各相關部會都會指派高層及人員參與，府院和國安會之間會保持密切合作與聯繫，直到菲律賓感受到我國的壓力，做出正確回應為止。
★ 江揆呼籲國人團結對菲施壓、理性對待菲國人民及在台菲勞、國際社會共同聲援
江宜樺說，政府會積極捍衛主權，結合海軍和海巡實力，密集巡弋我專屬海域、保護漁民，並優先提供優厚慰問金給受害家屬，持續對對方施壓，要求合理賠償。
他說，政府絕對不容許任何國家作出損害我國民安全及國家尊嚴之情事，政府也呼籲國人團結一致，共同對菲律賓政府施壓，但也呼籲國人不要訴諸激情，以理性方式對待菲律賓人民以及在台菲勞，以顯示我國民主法制的精神。
江宜樺表示，政府也呼籲國際社會的每一個國家都能重視這事件，共同聲援我無辜受害的漁民；政府也將加強對我國對國際社會的論述，要求外館加強對各駐在國及對國際的發聲，以強調我國在面對爭議時的理性態度、愛好和平解決爭端的精神。