高鐵列車及立委服務處炸彈案，警政單位的表現有目共睹，但也有單位遭受批評。國民黨立委江啟臣今(17)日痛批行政院國土辦公室，竟然在事件發生當下，先選擇撇清關係，他建議備詢的副祕書長陳威仁好好檢討，若再無任何做為可以考慮裁撤。
立法院內政委員會上午邀內政部長李鴻源、行政院秘書長陳威仁、行政院公民投票審議委員會主任委員吳永乾就「呂秀蓮版公投報告」進行專案報告並備質詢。不過江啟臣卻將矛頭，指向最近廣受討論的炸彈案。
江啟臣表示，國際上對恐怖活動有個廣意的解釋，那就是「針對不特定平民發動攻擊，以達成某種訊息的散播效果」，但雙炸彈案發生當下，國土辦公室竟在尚未釐清案情前，就主動排除這是刑事案件而非恐怖活動，這樣的做法讓人質疑。
他還拿出行政院組織章程，強調國土辦公室所負責的項目，包括反恐基本方針、演練訓練、資訊交換與相關應變等，但目前國土辦公室主任，竟然由前陸委會文教處處長陳會英擔任，他質疑該人是否有能力來負責這些業務。
最後他還批評正在興建的反恐訓練中心，從93年提案到現在，但過了10年至今尚未完工。
面對立委的批評，陳威仁只回應，在事件發生時，國土辦公室有與警方保持連繫；但立委接著問「是否參與調查？」陳威仁表示並沒有，但再強調，「有跟警方保持連繫，並初步排除是一個恐怖活動」。
江啟臣不滿的說，發生意外當下，政府應該有相關回應與舉措，而非第一時間說「跟哪個無關」。如果國土安全辦公室再無做為，建議專則到刑事警查局或國安局，該單位可以考慮裁撤。
另一位備詢官員李鴻源則在說明案情時提到，未來將釐清高鐵炸彈案的犯案動機，並定義是否為恐怖攻擊。這樣的說法，與國土辦公室的定調完全矛盾。