衛生福利部繼續追查西藥廠之碳酸鎂、碳酸鈣原料使用狀況，並於18日公布第二波全面清查結果，發現有19家業者共23項產品不符規定，主要涉及使用食品級或食品添加物許可證之碳酸鎂（鈣）作為主成分。這次查出的問題業者並未使用工業用碳酸鎂（鈣），但使用的僅是食用級原料，並未取得原料藥許可證。衛生福利部食品藥物管理署已要求廠商將相關產品於4月22日午夜前下架，30日內完成回收（3家藥廠已主動回收涉案產品)，庫存品封存停止出貨。
台中市衛生局表示，台中市內的製藥廠，有新萬仁化學製藥股份有限公司「金十字酵素胃腸藥顆粒」1項、永信藥品工業股份有限公司台中幼獅廠接受台灣大正製藥股份有限公司委託製造「大正俾胃壯錠」1項、明大化學製藥股份有限公司「育胃源錠」及接受天理生物科技有限公司委託製造「天理寧咳散」2項、另本市振貿股份有限公司委託屏東縣永吉製藥股份有限公司製造「振貿碳酸鈣錠500公絲」，共4家5項產品列入不合格名單。
台中市衛生局表示，經食藥署查獲不符規定者，已立即要求業者將產品下架回收，並視違反情節，以違反藥事法第21條處新台幣6萬至30萬元罰鍰，或依違反藥事法第57條（嚴重違反GMP規定:限期改善、涉案產品停止生產，並處新台幣3萬至15萬元罰鍰）處置。