總統表示，因為他深刻地相信，「侵略的錯誤或可原諒，但歷史的真相不能遺忘」，往後，他還是會秉持中日和約當中合作與和平的精神，及「就事論事、將心比心、恩怨分明」的態度，推動中華民國與日本關係發展，面對歷史，迎向未來。
馬總統上午出席「戰爭的歷史與記憶：抗戰勝利七十週年國際學術研討會」開幕式暨抗戰史叢書發表會致詞時，作以上表示。
總統說，中日和約的開頭有一段話，「鑒於兩國由於其歷史文化關係及領土鄰近而產生之相互睦鄰願望；了解兩國之密切合作對於增進其共同福利及維持世界和平與安全，均屬重要」。
他表示，所以從他就任中華民國總統以來，中華民國政府一直在發揚中日和約精神，將兩國關係認定為「特別伙伴關係」。兩國1972年斷交40多年來，到去年為止，中華民國與日本一共簽署了58項協議；而僅僅在他任內就簽署25項，占了43％，包括台日投資協議、台日漁業協議，尤其是後者特別重要。
總統說，大家都知道在2012年釣魚台風雲再起，日本國有化釣魚台的結果，在大陸20個城市造成大規模反日示威，他在當年8月5日，也就是中日和約生效60週年當天，提出東海和平倡議，呼籲擱置主權爭議，共同開發資源；8個月後，中華民國就跟日本簽訂台日漁業協議，在台灣兩倍大的海域，漁民打漁不再受到任何干擾，這是40年來糾紛的唯一一次解決。
他表示，這最重要凸顯的概念就是，「主權無法分割，資源可以共享」，透過這樣的理念，得到了台日漁業協議，使得雙方能夠和平相處，真正符合聯合國海洋法公約所說的，一個共同養護與管理區。
總統指出，美國國務卿凱瑞（John Kerry）、國務院亞太助卿羅素（Daniel Russel）與澳洲國防部長詹斯頓（David Johnson），都對台日漁業協議表示高度肯定，因為這個是用和平解決國際爭端最好的辦法。
他說，民國100年，中華民國也與日本完成台日航約修約，日本完全開放天空，中華民國飛日本的航線與航點，都有非常大的增加。去年中華民國訪日人次約297萬人次，是日本外籍旅客人數最多的國家；日本訪問台灣人次約163萬人次，也是台灣第二大境外旅客來源，雙方合計達460萬人次，比他上任前的人次幾乎增加了1倍。