李朝卿表示，政府做事因人而異，嘉義縣長張花冠、雲林縣長蘇治芬都曾涉案卻可以復職，「為何只有南投縣長李朝卿不可以？」
他也說，自己是縣民票選出來的縣長，內政部不同意復職案，對南投縣民很不公平，將先和律師討論，再決定是否再度提起訴願。
內政部表示，依照訴願會的撤銷理由，基本上認同內政部引用公務員懲戒法將李朝卿停職，而且公務員懲戒法也比地方制度法相關規定嚴謹，因此維持以公務員懲戒法作為李朝卿案處分依據，李朝卿若不服處分，可再向行政院訴願會提訴願。
行政院訴願會10日撤銷內政部4月22日否准因案停職的南投縣長李朝卿復職案，內政部在2個月內要對李朝卿案再另做處分，內政部今天綜合考量各項因素後，再次作出不同意李朝卿復職申請的決定。