高鐵局說，台南站旅客量是台北、台中及高雄三都外最多的，是南部都會區重要的需求點；台灣高鐵也發現，台南站上車的旅客，以到台北居多。
因高鐵南港站7月1日加入營運，高鐵北部端點站從台北站改為南港站，高鐵全面改點，停站模式仍是直達、半直達與站站停。
原本高鐵直達車的定義，台北到左營，中間只停靠板橋及台中。
不過，7月起，往返兩個端點站的直達車有新的定義，分兩種模式，一種是南港往返左營，中間停靠台北、板橋及台中，單程最快行駛時間是105分鐘，每週203班。
另一種直達車是南港往返左營，中間停靠台北、板橋、台中及台南，單程最快行駛時間是110分鐘，不過台北到台南只要100分鐘，每週89班。
半直達車則採跳蛙方式停靠，南港往返左營，中間停7站，單程最快行駛時間130分鐘。
站站停有3種模式，一是南港往返台中，二是台中往返左營，單程最快行駛時間都是72分鐘，另一是南港往返左營，中間10站全停靠，單程最快行駛時間是145分鐘。