高鐵在這次地震中受損嚴重，昨天嘉義以南全癱瘓，台灣高鐵公司稍早原表示經連夜搶修後，上午10時起台南嘉義路段修復，全線可雙向行駛；但10時左右再度宣布，由於設備受損嚴重，台中至左營仍暫停營運。
台灣高鐵10時30分發布最新營運訊息指出：台灣高鐵於今天清晨6時50分發布全線正常運轉訊息後，維修單位再一次進行營運前之雲、嘉、南地區最後巡軌時，新發現嘉義站以北10公里處(高鐵里程TK242及TK244二處，並非昨日搶修之台南歸仁路段)，電車線結構產生傾斜，且有逐漸惡化之現象，為顧及行車安全，高鐵公司立即派員現場檢視，因該搶修涉及工程車作業，高鐵公司已增派維修人員緊急搶修中。
同時，台灣高鐵宣布目前暫時僅提供台北--台中區間營運，並暫停台中—左營區間營運服務。後續會將修復狀況及最新營運訊息對外公告。