大陸軍艦穿越海域後，日本首相野田佳彥告訴記者，日本會繼續警戒監視。
根據聯合國海洋法公約（UNCLOS），國家對鄰接海域的主權僅限於移民管制和其他方面，外國船隻有權在鄰接海域自由航行。
然而，大陸軍艦16日航行在先島群島鄰接海域，距離釣魚台列嶼約200公里。
「朝日新聞」也報導，日本與大陸官員都對大陸軍艦出沒沖繩縣附近海域輕描淡寫，但雙方的言詞也顯示，引起爭議的釣魚台列嶼緊張情勢仍是一觸即發。
大陸艦隊包括2艘驅逐艦、2艘巡防艦、2艘潛艇救援艦和1艘補給艦。
大陸船艦雖未進入日本領海，卻穿過與那國島與西表島之間的鄰接海域，這是大陸海軍艦艇第一次被發現通過這兩島之間的海域。
野田的一名幕僚表示，大陸軍艦並未駛入釣魚台附近海域。他說，大陸現在也變得愈來愈謹慎。
16日上午，日本外務省亞洲大洋洲局長杉山晉輔認為，大陸艦隊正朝釣魚台前進，於是對大陸駐東京大使館提出抗議。杉山晉輔表示：「我們要求（中國政府）顧全日中關係大局，採取適當措施。」
日本政府16日下午證實，大陸軍艦並未朝釣魚台列嶼方向前進。內閣官房長官藤村修在記者會沒有直接批評北京當局，反而表示，「我們不確定中國的意圖」。
有人猜測，大陸船艦選擇航行不尋常的航線，通過與那國島與西表島之間的鄰接海域，是為了避開21號颱風。
大陸國防部針對這次演習向朝日新聞回應指出：「這是例行演練，通過（鄰接海域）既正當也合法。」
由於大陸軍艦穿越鄰接海域，日本已加強警戒。
日本上月將釣魚台3座島嶼國有化後，大陸海監船和其他船隻幾乎每天都駛入釣魚台列嶼附近。