農委會104年度歲入計畫釋股台肥9400萬股，可有48億5288萬8000元收入，以及投資資本收回9億4771萬2000元，合計編列58億元的歲入。
農委會農糧署長李蒼郎說明，農委會的台肥持股釋出9400萬股後，持股比率剩11.62%；釋出的股數，行政院同意由政府基金（公營事業或公股掌控事業）買下，而政府基金收購後的台肥持股比率為12.45%；兩方的台肥持股合計24.07%，並沒有任何改變。
但是民主進步黨籍立委陳明文質疑行政院尚未核定釋股案，農委會就於歲入編列58億元，違反公股股權管理要點。
陳明文與同黨籍立委蘇震清、葉宜津及黃偉哲等人也提案，主張台肥公司獲利斐然，農委會應長期持有。
此外，李蒼郎20日說，制度改變下，官方持股釋出，似已不能由公股收購；若要執行台肥釋股案，恐需行政院再研議執行方案。
綜合考量下，立法院今天決議刪除台肥釋股歲入預算。李蒼郎說，對農委會來說，此舉不影響歲出編列；但是中央政府總預算歲入及歲出需平衡，因此行政院需再設法處理少編列的58億元歲入。