陳水扁獲台北地院裁定當庭釋放，特偵組一天之內從「尊重法院裁定」，轉為「以抗告為原則」，態度的轉折，引發諸多爭議，也讓特偵組本周重擬策略時，不得不謹慎面對。特偵組未來若決定抗告，一旦反攻失敗，不排除以偵辦中的二次金改及機密外交等案另案聲押。

特偵組偵辦扁案第一波偵結前，曾就陳水扁移審後，羈押與否沙盤推演，多數認為釋放的可能性相當低。當北院裁定當庭釋放時，特偵組顯得有些措手不及。

特偵組將調整戰略。抗告部分，若高院支特特偵組，發回地院得面臨原合議庭審理。若首波反攻失利，再提抗告，便有可能上演台北地院與高院之前就羈押前太電財務長胡洪九引發的司法大戰，及檢察官與承審法官間羈押權裁量對抗。

高院雖有自為裁定羈押權，但考量扁身分特殊，羈押與否均會引發正反兩面評價，高院一方面尊重地院，二方面不太可能將押扁責任一肩扛下。

特偵組循抗告翻盤存在許多變數，亦可從另案聲押方式多管齊下。特偵組在偵辦扁家洗錢案，追出二次金改及機密外交等弊案，列為下波調查重點，但由於二次金改等案，目前仍有許多疑點尚待釐清，陳水扁獲釋，確有湮滅證據及勾串共犯、證人可能。

為了後續案情偵辦，並讓國人重拾對司法的信心，特偵組的下一步，能否「建立新的辦案文化」、「樹立檢察體系的典範」，備受各界矚目。