有人擔心，伴隨珊迪而來的洪水會迫使成千上萬的老鼠從地下爬上街頭；也有人擔心，老鼠淹死後，屍體隨著積水漂來漂去，紐約地鐵變成了一鍋老鼠湯。
沒有人知道紐約有多少老鼠，普遍的估計是紐約有八百萬人口，而鼠口與人口相當，因此至少有八百萬隻老鼠。但專家對此看法分歧。卡瑞生態系統研究中心疾病生態學家歐斯菲德表示，要知道珊迪過後老鼠命運如何，與估計到底有多少隻，一樣困難。
歐斯菲德指出，老鼠居住在非常低漥的地區，洪水來襲，老鼠會跑，也相當會游泳，淹死的老鼠相對屬於少數。他警告，老鼠跑到地面來，可能帶來鉤端螺旋體病和沙門氏桿菌等疾病。
另外，實驗機構的老鼠也在這次風災中落難。紐約大學神經科學研究所副所長費雪表示，單單他的實驗室就損失兩千五百隻老鼠。斯米洛研究中心員工估計，其他的研究計畫，其中包括癌症與心血管疾病和表觀遺傳學研究計畫，總計折損七千五百隻老鼠。費雪指出，不論從哪一方面來看，這絕對是慘劇。