政治向右的輕快諷刺
與在《新世紀福音戰士》系列裡相對沉悶又中規中矩的文戲表現不同，庵野秀明在《正宗哥吉拉》彷彿能量大爆發，儘管這部作品的主軸是在探討政治，但庵野大量採用特寫和第一人主觀和觀眾主觀之間切換的剪接手法，讓哥吉拉系列久為詬病的文戲活了起來，過去負責向觀眾解說的人物，也從單一科學家分散到多個不同領域的專家，雖然這些角色仍有過於功能性和扁平化的問題，但在大量的台詞和不時除穿插的諷刺現實橋段下，巧妙地掩藏了這些缺點。
更高明的是，庵野將專家提升到主角的高度，並將日本方的人物分成象徵獨立與革新的主角派，和代表僵化與守舊的官僚派，再藉由主角派被官僚派壓制、官僚派再被哥吉拉打臉的循環下，逐步驗證主角派的觀點，同時也向觀眾透露庵野自身的「日本政治體制必須改變」和「不能只靠美國生存」右傾政治觀。
我們甚至可以誇張的說，庵野花了一個小時在諷刺日本政府無能，剩下的時間也全在感嘆美國如何決定日本的未來，但這些嚴肅的探討並沒降低電影整體的娛樂性，這些充滿無奈和諷刺的文戲，居然和哥吉拉的破壞行為相互呼應，反倒極大程度加強了作品本身的飽滿感。
從原爆到311：日本在21世紀的不安感
雖然《正宗哥吉拉》大量拋去既有的風格，但在シン・ゴジラ那歷代最狂的恐怖造型下，仍可窺見初代哥吉拉的反核、反戰精神，差別在這些主題被濃縮和轉化成屬於日本在21世紀的憂慮。
首先シン・ゴジラ不再採用從原爆誕生的設定，改為疑似不明生物「食用」核廢料後進化而成的完美生命體，但シン・ゴジラ在造型上仍參考了初代的廢棄原案，例如蘑菇狀的頭顱來自於原爆的蕈狀雲，通紅且不規則的表皮則取材自原爆受害者的樣貌，至於最具特色的手掌朝上部分，筆者認為應該是在象徵反抗與復仇。
不過シン・ゴジラ與初代相關的部分也就僅止於此，對當今的日本來說，二戰的傷痛和第五福龍丸號事件已經有些遙遠，21世紀的哥吉拉需要一個更貼近現代的隱喻，而シン・ゴジラ所選擇的就是2013年的311大地震。
但或許是311災害的傷痛太過巨大，連毫不留情批判日本政治的庵野也用較隱晦的方式來傳達シン・ゴジラ與311的連結，這可從以下簡單對照可以大致發現シン・ゴジラ與311之間的關係：
シン・ゴジラ初登場被認為是海底火山 ＞ 海底板塊運動
シン・ゴジラ以第一姿態上岸 ＞ 地震後的海嘯
シン・ゴジラ登陸後殘留的輻射被隱瞞 ＞ 福島核災
偵測到輻射後美軍航母緊急離港 ＞ 福島核災
上述除了美軍航母離港在片中營造的太刻意外，其餘部分都很自然的運用在片中，特別是シン・ゴジラ以第一姿態出現登陸時，以匍匐姿態推開船隻和撞倒建築物的畫面，幾乎就是宮城海嘯的重現，不過最令人叫絕的部分，就屬片中シン・ゴジラ曾因為需要冷卻而返回大海，到片尾時人類用「灌食」凝血劑打敗シン・ゴジラ的作戰，完全就是當年福島核電廠救災的重現。
當然化身為移動災難的シン・ゴジラ不會只有福島核災的寓意，透過シン・ゴジラ這個載體所誘發的效應，當哥吉拉已經在肆虐市區時，街上的廣播仍在用極其緩慢的聲調要求民眾盡快避難的段落，無情的批判了日本社會已經像官僚的會議室一樣僵化，而日本為了解決シン・ゴジラ災難，卻又被美國乃至所謂的聯合國制肘時，也暗示日本在國際上的尷尬地位，但最讓人心碎的，還是當人類反擊失敗後，避難的民眾無助地看向觀眾的一幕，這畫面彷彿是向觀眾、特別是日本人做出無言的控訴與不安。
第一次衝擊+巨神兵+哥吉拉&etc=シン・ゴジラ
隨著人類內部以及和シン・ゴジラ之間的衝突不斷交織與擴大，《正宗哥吉拉》所累積的能量終於電影後段大爆發，シン・ゴジラ在破壞時所展現的高度靈活度，與預告中和電影前半那動作緩慢的形象實在差距甚遠，而飾演シン・ゴジラ的狂言師野村萬齋更是功不可沒，他用大膽卻細微的身體動作，成功表演出シン・ゴジラ的情緒和破壞力，這是過去哥吉拉、特別是日本哥吉拉難以媲美的。
而シン・ゴジラ毀滅東京的場面更直接致敬導演自身的兩部前作《新世紀福音戰士》與《巨神兵降臨東京》，不過庵野秀明並非只向過去的自己致敬，實際上整部《正宗哥吉拉》更像是東寶特攝電影的藏寶箱，除了刻意大量採用昭和時代的音樂外，還致敬了初代哥吉拉著名的「翻橋」和「跟火車有仇」的場面，但最難能可貴的是，庵野毫不避諱的採用《酷斯拉》(Godzilla 1998)的無性生殖設定，對一些極端的哥吉拉影迷來說，光是聽到酷斯拉三個字就足以讓他們火冒三丈，因此庵野的做法對影迷來說可是相當大膽，但他「有趣就是好」的想法，吸納了過去無數的作品納為己用，最後讓《正宗哥吉拉》成為不亞於哥吉拉任何時期的最傑出作品的經典。
儘管庵野秀明大體上不負他的「宮崎駿的乾兒子」和「富野富野由悠季私生子」威名，但如果觀眾對國際社會和日本政治沒有一定程度的認知，《正宗哥吉拉》恐怕會是讓他們難以下嚥的作品，シン・ゴジラ在電影前中段緩慢的移動與隱藏腿部動作的取巧運鏡，也代表日本電腦特效與好萊塢尚有一段差距，但這距離比起過去已經進步不少，而就算觀眾對本片的文戲冷感，看到シン・ゴジラ片末的超狂破壞大概也已值回票。
而擅長營造「懸念」的庵野，也故意讓哥吉拉在片中最後兩次的吼叫聲中，用上了初代和1984年版哥吉拉的聲音，而這兩部都是昭和和平成時期前的第一部哥吉拉電影，或許這也是向觀眾暗示《正宗哥吉拉》將是一個新時期的開始。
同時《正宗哥吉拉》也向日本傳統的特攝系列開市，就算是有歷史包袱的作品，只要夠大膽的打破傳統和融入當代的世界，也能創作出新一代的經典，但就像《正宗哥吉拉》最後一幕中，在哥吉拉的尾巴上出現的「哥吉拉人」所警惕的一樣，再怎麼大破大立，也不能忘卻作品原有的精神。